自2026年1月3日起，台北及新北捷運已開放QR Code掃碼乘車服務，讓乘客可以使用手機上的電子支付APP進出站。目前支援的電子支付業者相當多元，包含TWQR（多家銀行支援）、悠遊付、iPASS MONEY、icash Pay、街口支付、全支付、玉山Wallet、全盈+PAY、台新Pay等。
若要使用QR Code乘車碼，首先需要開啟電子支付APP，並選擇「乘車碼」功能。進出站時，將乘車碼對準驗票機掃描，待螢幕顯示「掃碼成功」即可完成扣款。重要的是，進出站必須使用相同的支付APP。為了加快通行速度，建議事先開啟APP並提高手機螢幕亮度。如果掃碼失敗，可以尋求站務人員協助。若電子支付帳戶餘額不足，將無法進站，但若進站後餘額不足，支付業者會代墊一次車資。
使用QR Code乘車碼搭乘北捷可享有常客優惠，回饋金將於次月5日撥入支付帳戶。值得注意的是，如果使用不同的支付工具或帳戶，回饋金將分開計算，無法合併。另外，使用悠遊付、iPASS MONEY及icash Pay乘車碼可享有轉乘優惠，但其他支付服務則不提供轉乘優惠。此外，北捷也與乘車碼支付業者合作推出「綁定乘車碼，好康再加碼」活動，在2026年1月3日至6月30日活動期間，每月使用乘車碼搭乘捷運，都有機會參加抽獎，獲得捷運一日票。
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