Click-to-Run (C2R) 是 Microsoft 主推的 Microsoft 365 安裝形式，相較於 Windows Store 的 Appx 格式，C2R 在企業應用上具有多項顯著優勢。雖然兩者在使用體驗上差異不大，但底層架構、更新策略和企業支援度卻截然不同。微軟已明確指出，未來使用者必須改用 C2R 安裝版本才能持續獲得更新，這也意味著 C2R 已成為企業用戶的首選。
C2R 的優勢在於其高度的彈性。首先，C2R 的更新頻道非常彈性，企業可以根據自身需求設定每月或每半年更新一次。其次，C2R 與 Windows 原生系統整合更緊密，支援群組原則、集中部署、遙測控管等企業級需求。對 IT 管理者而言，C2R 是一個真正可控、可維護的部署工具，能夠有效降低管理成本並提高效率。
過去，微軟曾大力推動通用 Windows 平台 (UWP)，希望實現「一套程式碼，橫跨所有裝置」的願景。然而，由於 UWP 採用沙盒設計、限制系統權限，導致許多傳統軟體無法完全移植，加上開發門檻高、效能差異等問題，最終未能獲得廣泛採用。如今，微軟宣布停止對 Microsoft Store 安裝的 Microsoft 365 應用程式提供功能更新，等於正式宣告 UWP 不適合當今複雜的使用情境，而 C2R 則成為更穩定的選擇。
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